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并展现栽培金鱼草S-位点与野生金鱼草S-位点之间具有高度的共线性

发布时间:2019-05-18 10:52 来源:未知 编辑:admin

  金鱼草(Antirrhinum majus L.)也称龙头花(snapdragon),车前科众年生草本植物,因花似金鱼或龙头而得名,是常睹的盆栽、切花及天井鉴赏的园艺花草,正在古罗马时间就已已毕了驯化。正在过去的三十年中,金鱼草不绝动作分子和发育遗传学的形式作物,良众症结基因是正在金鱼草中被初度创造,包含MADS家族成员DEF、TCP家族成员CYC、把握花瓣外皮细胞式样的MYB基因MIXTA、花色基因ROSEA、VENOSA以及把握自交不亲和的SLFs(S-Loucs F-box)等。金鱼草中内正在活泼的转座子督促了基因的分辨和明白。可是,迄今为止,这些探求都是正在欠缺基因组序列条款下实行的,无法探求这些基因、转座子和性状的具体进化和遗散布局。

  克日,中邦科学院遗传与发育生物学探求所薛勇彪探求组结合梁承志探求组、John Innes中央Enrico Coen探求组和华大基因等探求团队,诈欺第二代Illumina基因组测序平台和第三代PacBio单分子测序手艺,团结遗传图谱辅助拼装战略,已毕了对栽培金鱼草(Antirrhinum majus cv. JI7)的全基因组序列测定。

  该探求取得了金鱼草(2n=2x=16)8条染色体的分子序列510Mb,掩盖度为97.12%,解说了37714个卵白编码基因,讲演了一个近乎无缺的金鱼草基因组。通过对序列的比拟明白显示,车前科与茄科正在大约六千二百万年前从其近来的先人处隔离并正在大约四千六百万到四千九百万年前爆发了全基因组复制事情,该全基因组复制对金鱼草中与花错误称性相干的TCP基因家族进化具有紧要进献。别的,该探求创造金鱼草的假S位点(ψS-locus)正在大约2Mb的序列上含有102个基因,此中蕴涵37个SLF基因但缺失S-RNase,提示该花柱因子的遗失是栽培金鱼草得回自交亲和性状的首要道理,并创造栽培金鱼草S-位点与野生金鱼草S-位点之间具有高度的共线性。综上,金鱼草基因组的破译将极大加快这个形式生物的基因组学和进化探求。

  该探求结果于1月29日正在线公布正在Nature Plants杂志(DOI:10.1038/s4-9)。薛勇彪探求组李苗苗、张冬芬、张辉,梁承志探求组高强、马斌,中科院北京基因组探求所骆迎峰和华大基因陈春海为论文的协同第一作家,薛勇彪、梁承志、Enrico Coen和华大基因尹烨为论文的协同通信作家。该探求取得中科院策略先导项目、邦度科技部及邦度自然科学基金委的经费接济。

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